一、制作基因身份证，明确血统来源
每一头獒的DNA数据都是独一无二、终身不变的，将这种检测数据转换成的彩色条形码，将可终身标识，可用于识别其身份的特征。在种獒认证中，采集样品提取DNA，可以长期保存，为开展基因辅助育种提供资源，对每头申报种用的獒进行DNA检测，是目前对藏獒进行管理最有效的做法。通过检测，得到数据，进行分析，制作颁发基因身份证，通过比对，可明确其血统来源，结合申报资料，综合审定其是否符合种獒资格。将所获得的DNA检测相关数据输入数据库中，为藏獒提供分子水平上的支持。另外，当被检测藏獒发生丢失、误认、偷盗或其他情况时，可以通过DNA身份特征进行身份认定。
二、开展亲权鉴定
藏獒DNA数据不仅是每一头獒独一无二的身份特征，而且还能被随即的分离出一半给下一代，与另一头配对獒的一半DNA汇合成完整的DNA数据。因此可以通过这种DNA检测，确认两头或三头獒的亲权关系，确保藏獒的纯种繁育。在种獒认证中，一般要求对被认证的獒进行亲缘关系鉴定，以确定其血缘关系。目前，在开展的藏獒DNA亲权鉴定工作中，其累积非父排除概率（Cp）为0.9996。
三、进行不同样本的DNA同一鉴定
DNA数据是藏獒终身不变的数据，同一头獒无论在何地、何时、何人、獒体的什么部位所采样本，其检测的DNA数据都是一样的。因此能为藏獒各种纠纷提供准确样本同一鉴定，累积个体识别率可达到（Cdp）0.999999999997。
四、开展血统系谱鉴定
这个功能其实是亲权鉴定几个世代的累积，一个有几个世代的獒群，因各种亲缘关系会有一个复杂的血统系谱结构，通过一代代的亲权鉴定，能建立一个准确的DNA系谱结构，避免无目的的近交和杂交所造成的整个群体退化，为良种藏獒的选种选配打下基础。
五、开展后代杂合度预测
选择两头公母獒配对繁殖时，理论上是亲缘关系越远越好，实质是利用了基因互作效应，通过检测配对獒的DNA数据，能预测后代杂合度，评估这种基因互作效应，应用于实际选配工作中，可以发挥积极作用。
六、开展基因育种
通过獒群的DNA检测数据分析和应用，可评估预测各獒群可能出现的表型差异性，可以评估群体资源在繁育中的变化范围和发展走向，为制定科学的选种选配计划提供技术支持。对于藏獒，由于其分布范围广、毛色差异大，而人们对藏獒标准的认识也不统一，因此，通过对獒群DNA数据的分析，也能探讨品种起源和分化，建立品种遗传结构。而那些特别优秀的藏獒个体，通过DNA数据的群体遗传统计，能最终锁定其决定性基因或连锁基因标记，通过基因辅助育种，能快速扩展优秀个体数量，达到育种目的。
